Su función primordial era guarnecer la Villa de Nuestra Señora del Desterro, actual Florianópolis, contra las embarcaciones enemigas que por ventura accedía a la Isla por la Bahía Sur.
Durante el siglo XIX, el antiguo Fuerte sirvió de lazareto y enfermería militar. En 1875, abrigó la Capitanía de los Puertos y, en 1893, sedujo al Gobierno del Estado. Las varias reformas que ha pasado a lo largo de los años y los vertederos que lo alejaron del mar, lo dejaron completamente descaracterizado.
Fue declarado como Patrimonio Histórico y Artístico Nacional en 1984. Ocupado hasta 1999 por una agencia de la Capitanía de los Puertos de Santa Catarina y hoy alberga el Centro Cultural de la Marina en Santa Catarina (CCMSC).
En la región cercana al Fuerte Santa Bárbara, se pueden visitar también el Fuerte de Santana, la Antigua Aduana, el Mercado Público, la Catedral Metropolitana, el Museo Histórico de Santa Catarina, el Museo Victor Meirelles, el Museo del Saneamiento y la Iglesia del Niño Dios.
Fuerte de Santa Bárbara da Vila está ubicado a la calle Antônio Luz, 260, frente al Terminal Urbano de Autobús Ciudad de Florianópolis, en el terraplén de la Bahía Sur, centro de la ciudad. Se puede llegar al Fuerte a pie o en auto.